Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL5P13501 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL5P13501 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL5P13501 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL5P13501 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL5P13501 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL5P13501 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL5P13501 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL5P13501 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL5P13501 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL5P13501 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCL5P13501 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL5P13501 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL5P13501 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL5P13501 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL5P13501 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL5P13501 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL5P13501 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCL5P13501 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL5P13501 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL5P13501 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL5P13501 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL5P13501 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL5P13501 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL5P13501 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL5P13501 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms