Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ESRRAP11474 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRAP11474 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms