Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYGBP11216 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYGBP11216 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYGBP11216 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYGBP11216 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYGBP11216 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYGBP11216 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYGBP11216 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYGBP11216 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PYGBP11216 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYGBP11216 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PYGBP11216 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PYGBP11216 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYGBP11216 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYGBP11216 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYGBP11216 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYGBP11216 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PYGBP11216 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PYGBP11216 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms