Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPP1P10451 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPP1P10451 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPP1P10451 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPP1P10451 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPP1P10451 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPP1P10451 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPP1P10451 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPP1P10451 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPP1P10451 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPP1P10451 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPP1P10451 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPP1P10451 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPP1P10451 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPP1P10451 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPP1P10451 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms