Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIGD3P0DMS9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms