Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM200BP0CF97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms