Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SUPT20HL2P0C7V6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SUPT20HL2P0C7V6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUPT20HL2P0C7V6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUPT20HL2P0C7V6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUPT20HL2P0C7V6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms