Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L7P0C7H9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms