Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPM2P07951 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPM2P07951 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPM2P07951 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPM2P07951 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPM2P07951 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPM2P07951 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPM2P07951 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TPM2P07951 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TPM2P07951 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPM2P07951 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPM2P07951 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPM2P07951 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPM2P07951 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPM2P07951 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TPM2P07951 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TPM2P07951 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPM2P07951 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPM2P07951 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPM2P07951 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPM2P07951 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms