Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A1P02730 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A1P02730 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms