Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOEP02649 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOEP02649 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOEP02649 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOEP02649 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOEP02649 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOEP02649 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOEP02649 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOEP02649 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOEP02649 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOEP02649 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOEP02649 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOEP02649 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOEP02649 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOEP02649 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOEP02649 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOEP02649 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOEP02649 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOEP02649 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOEP02649 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOEP02649 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOEP02649 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOEP02649 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOEP02649 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOEP02649 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOEP02649 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOEP02649 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOEP02649 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms