Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms