Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFNA21P01568 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms