Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCAP01258 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCAP01258 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCAP01258 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCAP01258 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCAP01258 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCAP01258 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCAP01258 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCAP01258 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCAP01258 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCAP01258 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCAP01258 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCAP01258 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCAP01258 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCAP01258 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCAP01258 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCAP01258 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCAP01258 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCAP01258 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCAP01258 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCAP01258 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCAP01258 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCAP01258 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALCAP01258 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALCAP01258 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms