Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD2O96028 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD2O96028 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD2O96028 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NSD2O96028 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NSD2O96028 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NSD2O96028 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NSD2O96028 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NSD2O96028 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD2O96028 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSD2O96028 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSD2O96028 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NSD2O96028 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD2O96028 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD2O96028 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD2O96028 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD2O96028 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD2O96028 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD2O96028 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD2O96028 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD2O96028 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD2O96028 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD2O96028 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD2O96028 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD2O96028 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD2O96028 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD2O96028 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD2O96028 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD2O96028 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD2O96028 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD2O96028 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD2O96028 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NSD2O96028 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD2O96028 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD2O96028 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD2O96028 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD2O96028 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD2O96028 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD2O96028 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD2O96028 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD2O96028 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD2O96028 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD2O96028 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD2O96028 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD2O96028 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSD2O96028 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSD2O96028 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSD2O96028 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSD2O96028 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSD2O96028 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSD2O96028 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSD2O96028 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NSD2O96028 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms