Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GGPS1O95749 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGPS1O95749 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms