Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD1O95696 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD1O95696 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD1O95696 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD1O95696 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRD1O95696 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRD1O95696 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD1O95696 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD1O95696 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD1O95696 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD1O95696 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD1O95696 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRD1O95696 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRD1O95696 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRD1O95696 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD1O95696 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD1O95696 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD1O95696 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD1O95696 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD1O95696 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRD1O95696 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRD1O95696 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRD1O95696 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRD1O95696 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRD1O95696 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRD1O95696 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRD1O95696 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRD1O95696 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms