Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR4O95473 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR4O95473 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms