Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PCF11O94913 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCF11O94913 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCF11O94913 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCF11O94913 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCF11O94913 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCF11O94913 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCF11O94913 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCF11O94913 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCF11O94913 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PCF11O94913 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCF11O94913 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCF11O94913 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCF11O94913 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCF11O94913 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCF11O94913 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCF11O94913 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCF11O94913 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCF11O94913 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCF11O94913 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PCF11O94913 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCF11O94913 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCF11O94913 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PCF11O94913 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
PCF11O94913 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCF11O94913 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PCF11O94913 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCF11O94913 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCF11O94913 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCF11O94913 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCF11O94913 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCF11O94913 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCF11O94913 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCF11O94913 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCF11O94913 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PCF11O94913 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCF11O94913 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCF11O94913 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PCF11O94913 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCF11O94913 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCF11O94913 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCF11O94913 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCF11O94913 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCF11O94913 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCF11O94913 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCF11O94913 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PCF11O94913 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PCF11O94913 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PCF11O94913 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
PCF11O94913 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms