Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF6O94906 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms