Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM2O94769 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM2O94769 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM2O94769 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM2O94769 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM2O94769 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM2O94769 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM2O94769 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM2O94769 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM2O94769 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM2O94769 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM2O94769 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM2O94769 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ECM2O94769 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM2O94769 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM2O94769 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM2O94769 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM2O94769 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM2O94769 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ECM2O94769 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM2O94769 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM2O94769 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ECM2O94769 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM2O94769 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM2O94769 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM2O94769 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM2O94769 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECM2O94769 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM2O94769 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM2O94769 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM2O94769 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM2O94769 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM2O94769 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM2O94769 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms