Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT34O76011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT34O76011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT34O76011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT34O76011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT34O76011 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT34O76011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT34O76011 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT34O76011 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT34O76011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT34O76011 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT34O76011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT34O76011 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT34O76011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT34O76011 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT34O76011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT34O76011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms