Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMUO75648 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMUO75648 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMUO75648 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMUO75648 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMUO75648 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMUO75648 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMUO75648 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMUO75648 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMUO75648 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMUO75648 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMUO75648 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMUO75648 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMUO75648 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRMUO75648 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMUO75648 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMUO75648 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMUO75648 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMUO75648 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMUO75648 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMUO75648 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMUO75648 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms