Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS26AO75436 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms