Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC45O75419 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC45O75419 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC45O75419 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC45O75419 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC45O75419 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC45O75419 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC45O75419 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC45O75419 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDC45O75419 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC45O75419 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC45O75419 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC45O75419 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC45O75419 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC45O75419 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC45O75419 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC45O75419 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC45O75419 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC45O75419 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC45O75419 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC45O75419 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDC45O75419 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDC45O75419 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC45O75419 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC45O75419 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms