Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22BO75396 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms