Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA3O75145 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA3O75145 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms