Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED4O75132 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED4O75132 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms