Protein–RNA interactions for Protein: O60942

RNGTT, mRNA-capping enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNGTTO60942 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNGTTO60942 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNGTTO60942 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms