Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSCO60682 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSCO60682 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSCO60682 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSCO60682 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSCO60682 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSCO60682 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSCO60682 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSCO60682 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSCO60682 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSCO60682 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSCO60682 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSCO60682 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSCO60682 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSCO60682 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSCO60682 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSCO60682 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MSCO60682 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSCO60682 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSCO60682 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSCO60682 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSCO60682 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSCO60682 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSCO60682 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSCO60682 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSCO60682 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSCO60682 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSCO60682 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSCO60682 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSCO60682 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSCO60682 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSCO60682 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MSCO60682 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSCO60682 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSCO60682 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSCO60682 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSCO60682 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSCO60682 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSCO60682 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MSCO60682 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MSCO60682 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSCO60682 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSCO60682 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSCO60682 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSCO60682 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSCO60682 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSCO60682 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSCO60682 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSCO60682 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSCO60682 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSCO60682 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSCO60682 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSCO60682 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSCO60682 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSCO60682 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSCO60682 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSCO60682 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms