Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GFRA3O60609 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA3O60609 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA3O60609 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms