Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PPLO60437 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PPLO60437 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PPLO60437 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PPLO60437 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PPLO60437 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PPLO60437 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PPLO60437 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PPLO60437 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PPLO60437 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PPLO60437 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PPLO60437 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PPLO60437 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PPLO60437 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PPLO60437 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PPLO60437 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PPLO60437 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PPLO60437 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PPLO60437 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PPLO60437 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PPLO60437 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PPLO60437 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPLO60437 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPLO60437 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPLO60437 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPLO60437 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPLO60437 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PPLO60437 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PPLO60437 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PPLO60437 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PPLO60437 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PPLO60437 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PPLO60437 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PPLO60437 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PPLO60437 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PPLO60437 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PPLO60437 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PPLO60437 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PPLO60437 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PPLO60437 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PPLO60437 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PPLO60437 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PPLO60437 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPLO60437 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPLO60437 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PPLO60437 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms