Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX15O60248 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOX15O60248 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOX15O60248 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SOX15O60248 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOX15O60248 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOX15O60248 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX15O60248 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX15O60248 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms