Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5O60239 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms