Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL13O43927 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL13O43927 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL13O43927 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms