Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3O43889 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3O43889 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3O43889 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3O43889 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3O43889 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3O43889 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3O43889 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3O43889 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3O43889 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3O43889 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CREB3O43889 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3O43889 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3O43889 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3O43889 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3O43889 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3O43889 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3O43889 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3O43889 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3O43889 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3O43889 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREB3O43889 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms