Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP9O43818 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP9O43818 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP9O43818 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP9O43818 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP9O43818 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP9O43818 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP9O43818 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP9O43818 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP9O43818 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP9O43818 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP9O43818 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP9O43818 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP9O43818 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP9O43818 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP9O43818 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP9O43818 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP9O43818 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP9O43818 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP9O43818 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP9O43818 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP9O43818 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP9O43818 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRP9O43818 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP9O43818 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP9O43818 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP9O43818 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP9O43818 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP9O43818 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP9O43818 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP9O43818 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP9O43818 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP9O43818 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP9O43818 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms