Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BUD23O43709 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BUD23O43709 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BUD23O43709 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BUD23O43709 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BUD23O43709 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BUD23O43709 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BUD23O43709 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BUD23O43709 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BUD23O43709 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BUD23O43709 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BUD23O43709 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BUD23O43709 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BUD23O43709 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BUD23O43709 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BUD23O43709 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BUD23O43709 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BUD23O43709 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms