Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK2O43353 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK2O43353 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms