Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTSS1O43312 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms