Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN3O15551 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN3O15551 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN3O15551 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN3O15551 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN3O15551 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms