Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLOCKO15516 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLOCKO15516 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms