Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SYNJ2O15056 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SYNJ2O15056 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNJ2O15056 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ2O15056 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms