Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HIP1O00291 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIP1O00291 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIP1O00291 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIP1O00291 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIP1O00291 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIP1O00291 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIP1O00291 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIP1O00291 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIP1O00291 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIP1O00291 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIP1O00291 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIP1O00291 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HIP1O00291 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIP1O00291 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIP1O00291 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIP1O00291 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIP1O00291 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIP1O00291 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIP1O00291 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIP1O00291 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HIP1O00291 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HIP1O00291 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HIP1O00291 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HIP1O00291 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIP1O00291 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HIP1O00291 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HIP1O00291 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms