Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNAP23O00161 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP23O00161 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms