Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QRE1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QRE1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QRE1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QRE1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QRE1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QRE1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QRE1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QRE1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QRE1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QRE1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QRE1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3QRE1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3QRE1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QRE1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QRE1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QRE1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms