Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QLW9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QLW9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QLW9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QLW9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QLW9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QLW9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QLW9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QLW9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QLW9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QLW9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3QLW9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3QLW9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QLW9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QLW9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QLW9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QLW9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QLW9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms