Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QKU1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QKU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QKU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QKU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QKU1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QKU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QKU1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QKU1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QKU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QKU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QKU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QKU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QKU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QKU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QKU1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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