Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
J3KRW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
J3KRW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KRW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KRW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KRW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KRW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KRW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KRW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
J3KRW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
J3KRW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KRW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms