Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E9PQ18 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E9PQ18 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E9PQ18 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E9PQ18 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E9PQ18 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E9PQ18 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PQ18 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PQ18 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PQ18 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PQ18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PQ18 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E9PQ18 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PQ18 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PQ18 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PQ18 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PQ18 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PQ18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E9PQ18 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PQ18 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PQ18 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PQ18 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PQ18 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E9PQ18 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E9PQ18 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E9PQ18 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E9PQ18 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
E9PQ18 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms